Jack's Space

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薛定谔中的好用脚本
本文总结了一些在薛定谔软件中非常实用的脚本工具,涵盖了分子对接、结构优化、结合能计算、动力学分析等多个方面。这些脚本可以帮助研究人员更高效地进行计算机辅助药物设计工作。
使用 FEP+ 进行化合物优化的笔记
本文总结了使用Schrödinger FEP+进行化合物优化的关键步骤和注意事项。内容涵盖了FEP+的使用前提条件、执行流程中的蛋白和配体准备、系列配体叠合、FEP图生成等关键步骤,以及可能遇到的问题和解决方案。这些笔记可以帮助研究人员更好地利用FEP+进行计算机辅助药物设计。