薛定谔中的好用脚本

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 2023/07/12 

薛定谔中的好用脚本

consensus_score.py 找活性化合物的相似分子时候综合分析对接、形状、指纹
active_site_identity.py 一系列叠合的复合物结构，分析口袋相似性
xray_restrained_minimization.py 使用 B-factor 为限制进行最小化
primex_polish.py 全自动晶体优化
qsite_binding_energies.py 高精度结合能
thermal_mmgbsa.py 根据动力学计算 GBSA
trajectory_bfactors.py 根据动力学计算 B-factor
xglide.py 比界面更好用
shape_screen_cluster.py 带聚类的基于形状筛选
cluster_by_scaffold.py 根据分子骨架聚类
trj_parch.py 轨迹除水
analyze_simulation.py 分析轨迹, 可以用在自动化脚本里
compare_similar_proteins.py 比较多个相似蛋白
interaction_fingerprints.py 计算互作评分, 用于下游神经网络
sitemap_difference_maps.py Sitemap 的加减

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